Al New York col·lapsat amenaça real en la forma d'una poderosa trituradora. Ell tractarà de prendre la ciutat en qüestió de minuts, però cal detenir juntament amb les tortugues ninjas mutants. Aquests tipus valents estan preparats per a qualsevol dificultat per salvar al seu poble natal de la bogeria. Cadascun dels personatges tindran la seva pròpia missió i propòsit, algú ha de preparar una poció per destruir l'altra mutant d'enderrocar llançadors de míssils, i algú per derrotar l'enemic en combat cos a cos. Totes les tortugues seran només tres intents, si vostè perd, la ciutat cauria.