L'equip de tortugues del ninja té un enemic molt seriós. El seu nom és Savanti Romero. Aquest vilà va construir una màquina del temps i ara recull monstres de tots els mons: passat i futur, per unir-los a un gran exèrcit vilà. Els herois han d'interferir amb els plans de l'enemic. Per fer-ho, hauran de visitar tots els llocs on Romero planeja anar, i neutralitzar a tots els que tracta d'apropar-se al seu costat. Mike, Raphael, Leo i Donald estan preparats per a viatges perillosos. Has d'escollir el primer parell d'aspirants, que serà transferit a l'antic Egipte. Allà es trobaran amb malvades mames. Dràcula i zombis els esperen en altres llocs no menys perillosos del joc Teenage Mutant Ninja Turtles Monstres Vs Mutants