Molts governants d'arreu del món utilitzen sovint diverses esquadres de mercenaris en comandament per realitzar operacions militars. Vostè, en el joc Comando, servirà en un d'ells. Haureu d’infiltrar-vos en el territori enemic i destruir diverses unitats de soldats. Al començament del joc recollireu una arma i municions amb què anireu a la batalla. En moure’s pel territori de l’enemic, busqueu el vostre oponent i apunteu-li una arma per obrir foc. Si la vostra vista és exacta, les bales impactaran contra l'enemic i el destruiran.