Les batalles de temporada comencen a Naruto Free Fight: Temporada 2. Entrant a la batalla: Naruto Uzumaki, Sasuke Uchiha i Kakashi. Trieu un heroi al qual ajudareu a derrotar els rivals i us traslladarà al lloc on començarà la batalla directament. Diversos enemics atacaran el teu personatge alhora. Apareixeran d’un en un, després en grups. Amb l'ajut de les tecles ZX, haureu de forçar el combatent a rebutjar els atacs, i és millor atacar-vos a vosaltres mateixos i avançar, recollint bons i passant nivells. Colpeja els teus oponents amb cops de puny i cops precisos. Utilitzeu les vostres habilitats especials només en casos extrems, quan hi haurà massa enemics a Naruto Free Fight: Season 2.