Choo Choo Charles Revenge us portarà a l'illa d'Aranearum, on un monstre terrible és rampant: un híbrid d'un gigàpider i un tren anomenat Charles. Un arxiver, un caçador de monstres, una vegada va poder derrotar un monstre conduint-lo a un túnel i calafat amb un escut protector especial. Però hi va haver un fracàs i Charles va aconseguir alliberar-se. Ell recorre l'illa buscant víctimes, i cal trobar-lo. L'Achivarius està de vacances, has de lluitar sense ell i tu, a diferència del caçador de monstres, caminaràs en comptes d'anar en tren. Busca l'illa, troba el monstre i destrueix-lo a Choo Choo Charles Revenge.