A la història de Secret Lagoon trobareu a Paul. És un mariner de tercera generació i sovint viatja a la seva petita embarcació a vela. L’heroi li encanta explorar nous llocs, fent viatges llargs. Aquesta vegada va tenir molta sort, va trobar una llacuna, que no està marcada en cap mapa. Semblava estrany, perquè pràcticament no hi havia taques blanques, tota l’illa estava marcada i investigada, i per alguna raó es va perdre aquesta llacuna. El capità ancorarà i examinarà el lloc amb detall. Vol descobrir-ho a través dels objectes trobats que hi havia abans que ell i per què ara està desert.