Imagineu que la vostra ciutat va ser atacada per extraterrestres que intenten capturar tantes persones com sigui possible com a presoners. Tu al joc Hero Masters seràs un heroi que haurà de lluitar. El teu personatge tindrà 10 superpoders, que s'han extret dels superherois més famosos. A mesura que avanceu pels nivells, podreu desenvolupar-los tots. Davant de tu a la pantalla apareixerà el carrer on estarà el teu heroi. Amb l'ajuda de les tecles de control dirigirà les seves accions. Haureu d'avançar i buscar l'enemic. Tan bon punt trobis un extraterrestre, ataca'l utilitzant una de les teves habilitats. Destruir l'enemic et donarà punts. Després d'acumular un cert nombre de punts, pots gastar-los en millorar qualsevol de les habilitats.
