Un noi anomenat Boboboy viatja a diversos planetes de la Galàxia i lluita contra diversos vilans. Tu en el joc Boboiboy Galaxy Run ajudaràs al personatge en aquesta aventura. Davant teu, el teu personatge serà visible a la pantalla, que es troba en un lloc determinat. Utilitzant les tecles de control guiaràs les seves accions. El vostre heroi haurà de córrer cap endavant per la superfície del planeta, agafant velocitat gradualment. En el seu camí hi haurà puntes que sobresurten del terra, caigudes i altres perills. Fareu saltar l'heroi i volar per l'aire a través de tots aquests perills. Havent trobat l'enemic, li dispararàs amb coàguls de foc. Així, destruiràs els oponents i aconseguiràs punts per això. També ajudeu el noi a recollir diversos articles útils escampats pel seu camí.
