Pixel Mario es proposa eliminar el regne dels bolets del domini dels esbirros del seu principal enemic, Bowser, a Mario Combat. El lampista fa temps que es prepara, estudiant diferents tipus d'arts marcials, i ara ha arribat el moment d'aplicar-les. Amb la teva ajuda, Mario es mourà saltant sobre plataformes. Quan et trobes amb un altre enemic, has de destruir-lo amb punys o puntades. Estalvieu la vostra energia, perquè hi ha una reunió per davant amb el principal enemic - Bowser, i és força fort. Utilitza les tecles de fletxa per moure't i la tecla A per atacar a Mario Combat.
