L'heroi del joc Subway Runner 3D va perdre l'últim tren del metro i va decidir tornar a casa a peu, però pel metro, sense sortir a la superfície. Un policia de guàrdia se'l va adonar i vol aturar-lo, perquè està totalment prohibit caminar pel metro fins i tot després que els trens ja no circulin. Però això no va aturar el nostre heroi; va accelerar i va córrer per desfer-se de la persecució del policia. Ajuda'l a evitar els obstacles, saltar per sobre o arrossegar-se per sota d'ells. Recull monedes i córrer serà rendible per a l'heroi a Subway Runner 3D.
