La treva entre els grups va durar gairebé un any, fins que es va trobar un virus en un dels ordinadors bandits. Ara, hem de començar una dura batalla en Metal Slug 4, per no deixar que el ciberataque es propagui al servidor principal. L'amenaça de la destrucció és forta, que pot absorbir no només el sistema informàtic dels lladres a la llei, sinó que es converteix en perillós per a la corporació"Anteus", que supervisa les xarxes d'Internet del país. Trevor Spacey i Kassel Nadia ja estan plens d'armes i estan preparats per precipitar-se amb vostès sobre els intrusos. No facis que l'equip esperi, deixi la zona de confort immediatament i comenci a lluitar contra adversaris.