Els extraterrestres van tornar al nostre planeta. Una vegada que ja es va reunir en convidats no convidats, van aconseguir espatllar-se amb grans pèrdues. Ara han arribat altres, bé, els agrada, de manera que la terra li va agradar, que estiguin preparats per obtenir qualsevol sacrifici per guanyar-lo. En el joc Alien Attack 2 es trobaran amb criatures misterioses, no són com les que estaven abans, però no s'utilitzen, només prenen les armes i destrueixen els monstres, sense donar-los l'oportunitat de guanyar. Per evitar que tornin a casa, cal arribar al cap principal i tractar amb ell. Sense un control centralitzat, l'exèrcit alienígena es desintegrarà i tornarà a la seva casa.