Al món dels píxels es va iniciar la fi del món. No se sap d'on van venir les hordes de morts vivents, que ara estan atacant ciutats petites i matant persones i convertint-les en similars. Però hi va haver gent valenta al món que va prendre les armes per defensar els seus assentaments. Vostè en el joc Pixel Shot serà un d'ells. El teu personatge haurà de recórrer els carrers de la ciutat i trobar tots els zombis. Amb l'ajut de les seves potents armes, ell li dispararà capaç de destruir tots els monstres. En el camí, haurà de recollir diversos articles que l'ajudaran a lluitar contra els morts vivents.