Un valent ninja de Kyoto va rebre tasques del cap de la seva comanda i el joc Super Ninja Hero haurà d'ajudar-lo a completar-lo. El teu heroi haurà d’entrar al castell d’un aristòcrata a través de la masmorra i robar-ne documents importants. Tota la masmorra serà una cursa d'obstacles continuada. Controlant hàbilment el teu heroi hauràs de superar-los a tots. A més, el teu heroi haurà de lluitar amb diversos monstres i soldats de protecció que es troben en aquest laberint. En el camí, haurà de recollir diversos articles i armes escampades per tot arreu.