En un món meravellós llunyà, criatures com Pokemon conviuen amb la gent. Cadascun d’ells té certes habilitats màgiques. Avui, amb el nou joc Pokémon Clover, tu i un dels Pokémon us heu posat a explorar el bosc. Abans que aparegui a la pantalla, veureu els vostres personatges que es mouran pel camí del bosc. Hauran de recollir una planta com el trèvol, que segons la llegenda té propietats màgiques. En això, seran obstaculitzats per diversos tipus de monstres. Haureu d’utilitzar el tauler de control per dirigir les accions del Pokémon. Sota la vostra guia, aplicarà diversos tipus d’atacs màgics i destruirà l’enemic.