A la segona part de Funny Throat Surgery 2, continuareu treballant com a dentista en un hospital. Els pacients amb malalties dentals vindran a la vostra cita. En primer lloc, haureu d’examinar acuradament la cavitat oral i diagnosticar el pacient. Després, apareixerà un tauler de control on es podran veure diversos instruments mèdics i medicaments. Si apliqueu aquests elements de manera coherent, realitzareu un conjunt d’accions destinades al tractament del pacient. Quan hàgiu acabat, ell estarà completament sa i començareu a tractar altres pacients.