A la segona part de Ninja Dogs 2, continuareu ajudant un equip de gossos ninja a lluitar contra els guàrdies del regne dels gats. Avui heu d’atacar els seus castells i capturar-los o destruir-los. Al davant, a la pantalla, veureu una determinada zona on es trobaran els edificis. Dins dels edificis, veureu gats soldats. S’instal·larà un canó a certa distància dels edificis. Amb la seva ajuda, dispararàs als teus gossos de guerra i, després d’haver volat a una certa distància, s’estavellaran contra la paret de l’edifici i destruiran els seus gats atacants. Per fer-ho, haureu de calcular les trajectòries dels vostres trets. Després de destruir tots els gats, rebràs punts i passaràs al següent nivell del joc.