El regne dels bolets no sembla ser tan gran i, tanmateix, s’hi ha acumulat tanta escombraria que ja no s’adapta a un abocador especialment designat. El rei va decidir llançar-ho tot al mar, però Mario hi està totalment en contra. A Super Mario Transporter, té la intenció d’eliminar personalment tots els residus del seu lloc natal, on seran destruïts o reciclats. Per a això, l'heroi va preparar diversos tipus de camions cisterna i altres vaixells. Però algú ha d’ajudar l’heroi a obrir les vàlvules de drenatge. Els residus no es poden confondre, són de diferents colors i han de coincidir amb el color del contenidor. On els abocaràs. Obriu les tapes i no barregeu líquids a Super Mario Transporter.