Magical Dragons Difference et portarà a un món on la màgia i la bruixeria tenen un paper important. Aquí no hi ha gent normal, perquè només viuen criatures. Posseir diferents graus d'habilitats màgiques. Entre ells, un lloc especial l'ocupen els dracs màgics. Són molt semblants als dinosaures, però aquí són considerats dracs i venerats com a animals sagrats. Recentment, un mag va decidir augmentar la població de dracs, però alguna cosa amb els seus encanteris no va funcionar i els dracs van aparèixer com a doppelgangers. No són reals, però molt semblants. Troba les diferències entre ells per entendre on és el real i on és el producte de la màgia a Magical Dragons Difference.