Els Pokémon han tornat i els trobareu al joc Monster Box a mesura que avanceu pels nivells. El jugador actuarà com a entrenador, però les pokeballs tradicionals es substituiran per cubs, però també contenen petits monstres. Al nivell, per completar-lo, heu de derrotar el monstre. O portar-lo a la boxa. Tingueu en compte que el color de la caixa ha de coincidir amb el color del Pokémon. Si un altre monstre comença a atacar-te, llança la caixa amb el teu monstre perquè derroti l'oponent. Cada nivell tindrà la seva pròpia situació. En el qual has de trobar la solució adequada per acabar amb el teu oponent i completar el nivell a la caixa de monstres.