A l'univers de Minecraft hi viu un noi anomenat Noob. El nostre heroi va ser emmarcat i empresonat per càrrecs falsos. Per demostrar la seva innocència, el nostre heroi ha de ser lliure i trobar proves. Tu al joc Noob Miner: Escape From Prison ajudaràs al nostre personatge a escapar de la presó. Davant teu a la pantalla serà visible per a la càmera on es troba el Noob. Haureu d'examinar-ho tot i utilitzar la clau mestra per obrir la porta de la cel·la. Després d'això, el teu personatge podrà trobar el pic. Amb la seva ajuda, començarà a cavar. Vostè, utilitzant les tecles de control, haurà d'indicar en quina direcció ha de dirigir l'excavació. La vostra tasca és sortejar tots els obstacles que trobareu en el camí del Noob, així com recollir diversos objectes útils situats sota terra.