Un noi anomenat Tom va heretar una petita fàbrica que estava en declivi. El nostre heroi va decidir començar a desenvolupar-lo. Al joc Mega Factory, l'ajudaràs amb això. El teu personatge serà visible a la pantalla davant teu, que estarà ubicat en una de les instal·lacions de la fàbrica. El primer que hauràs de fer és recórrer-lo i mirar-ho tot amb atenció. Haureu de recollir monedes d'or que estan escampades pel terra de l'habitació. Després posaràs en funcionament l'equip de fàbrica. Ella començarà a produir productes que haureu d'envasar. Després carregaràs el producte en un camió que el lliurarà als clients. Per això rebràs diners. Podeu gastar-los en l'adquisició d'equips nous per a la fàbrica, matèries primeres per a la feina i contractació d'empleats. Així que a poc a poc en el joc Mega Factory aniràs organitzant el treball de la fàbrica.
