Tres guerrers ninja estan involucrats en el joc Gone Rogue. Black Kuro, que llança amb habilitat shurikens, no té igual en això. El guerrer vermell Aka és tan bo per manejar una espasa que tothom es sorprèn. A més, l'espasa d'Aki té habilitats màgiques, pot frenar l'enemic si el fa mal. El ninja verd Midori és un tàctic. Habilment posa trampes en diferents llocs perquè l'enemic segur que hi ensopegui. Els tres guerrers van aparèixer a Gone Rogue per una raó. Van ser enviats per l'Emperador perquè els herois tractin amb el vilà Uzuri, que està robant un dels pobles més grans de l'imperi. Heu de destruir l'enemic abans que reculli tots els productes a Gone Rogue.