El valent ninja va fer molts enemics a causa de la seva integritat i actitud intransigent cap a tot allò que fa mal a persones innocents. Al joc Ninjas Return coneixeràs l'heroi en un dels dies més foscos de la seva vida. Va tornar a casa, però en lloc d'una trobada alegre amb la seva família, va ser testimoni de com el seu enemic, el Ninja Negre, va segrestar la seva dona i el va portar a una direcció desconeguda. L'heroi va immediatament a la seva persecució, però l'enemic està preparat, intentarà aturar l'heroi amb l'ajuda dels seus sequaços i monstres del bosc a Ninjas Return.
