La base de Merge Cars: Defense serà atacada i la vostra tasca és proporcionar una defensa eficaç i fiable. Col·loca els cotxes al llarg de la línia fronterera; fusionar-ne dos idèntics comportarà un augment del nivell del cotxe. Quan s'instal·len en una posició, els vehicles dispararan automàticament des de les torretes instal·lades al sostre. Cada cotxe de nova creació serà més potent que l'anterior, els atacs no s'aturen, així que cal fusionar-se més ràpidament. Els atacs s'intensificaran, els enemics augmentaran la seva força, de manera que haureu de proporcionar defenses més fortes per contrarestar-los a Merge Cars: Defense.