Les persones diminutes de colors formaran certes imatges en cadascun dels milers de nivells presentats al joc Pixel Jam Bus Puzzle. La teva tasca és ordenar les imatges i per això utilitzaràs vehicles: autobusos multicolors. Cada autobús porta passatgers que corresponen al seu color. La capacitat de cada autobús és diferent, s'expressa en un valor numèric al sostre del vehicle. Porta els autobusos a l'aparcament sota la imatge i els últims passatgers començaran a omplir els interiors d'acord amb el color de Pixel Jam Bus Puzzle.
