L'heroïna del joc Contra: Jungle Breach anomenada Mara és una antiga mercenària que es va retirar, però no va poder descansar. L'antiga guerrera va rebre una missió secreta que només es va poder completar amb la seva experiència. Es va registrar un avió desconegut d'origen sobrenatural aterrant a la selva. D'ell en van sorgir criatures estranyes amb tendències clarament agressives. La Mara ha de trobar-los i destruir-los. I l'ajudaràs movent-te per la selva i destruint criatures inusuals a Contra: Jungle Breach.
