Ben 10 no és aliè a l'arribada d'un altre lot d'aliens que volen calumniar els terratrèmols. Però en aquesta ocasió a Ben 10 Omnitrix Shadow, les coses es van posar molt més greus. Els extraterrestres eren dirigits per un cavaller amb armadura negra, va llançar un corrent d'energia a Ben, infectant el noi amb energia fosca. Llavors els intrusos van marxar ràpidament. Un heroi fosc s’ha instal·lat en l’heroi, que amb el pas del temps el convertirà en un monstre malvat, com tots els que es troben en l’omnitrix. Per solucionar la situació i desfer-se del virus, heu de trobar els tres dolents i destruir-los. Ajudar al personatge a tornar-se a ell mateix i evitar la transformació.