El jove Naruto és considerat un dels millors combatents cos a cos. Molt sovint, el nostre heroi ajuda en batalles contra les ordres ninja fosques. Per tant, avui haurà de completar diverses missions i en el joc Naruto Ninja Council l’ajudaràs en això. El vostre personatge serà visible a la pantalla que teniu al davant, que estareu en una zona determinada. Fent servir les tecles de control, faràs que el teu heroi avanci. En el seu camí es trobarà amb obstacles i trampes, que Naruto haurà de saltar o saltar a gran velocitat. Tan bon punt es troba l’enemic, comença la batalla. Haureu de colpejar l'enemic amb cops de puny i cops de peu, així com dur a terme tècniques. La vostra tasca és noquejar al vostre oponent i obtenir punts per això.